多年来，厄立特里亚政府在没有正式起诉和审讯的情况下，逮捕和监禁耶和华见证人，包括妇女和老人。这些耶和华见证人因为参与宗教活动或一些不明的原因而被监禁。在1993年，耶和华见证人没有参与独立公投，并因为良心的缘故而拒绝服兵役，因此总统阿费沃尔基在1994年10月25日颁布法令，撤销他们的公民身份。在实施征兵制之前，厄立特里亚政府容许人选择替代役。当时，不少耶和华见证人在不同的政府部门服替代役。当局会为完成这种服务的人颁发正式的证书，并且常常对他们的贡献作出肯定。可是，阿费沃尔基总统颁布法令后，安全部门根据这项法令监禁、虐待和骚扰耶和华见证人，企图迫使他们放弃信仰。

目前，有39名耶和华见证人仍被监禁（27名男子和12名女子）。2020年12月4日，28名耶和华见证人（26名男子和2名女子）获释。在此之前，他们因信仰缘故，被囚禁了5至26年不等。2021年1月29日，又1名耶和华见证人男子在被囚超过12年后获释。2021年2月1日，当局又释放3名耶和华见证人（1名男子和2名女子），这3人被囚禁4到9年不等。

厄立特里亚至今有四名耶和华见证人在监狱中死亡，有三名年长的耶和华见证人曾被拘留在环境恶劣的地方，结果在获释后死去。

2018年，有两名耶和华见证人被转送到迈赛瓦监狱后死去。哈布特米盖尔·特斯法马里亚姆于2018年1月3日去世，终年76岁。另一位是哈布特米盖尔·梅荷恩，他于2018年3月6日去世，终年77岁。他们在2008年未经起诉就被监禁。

在2011年和2012年，有两名耶和华见证人因在梅特尔监狱受到不人道的对待而死去。米斯金纳·盖布拉廷萨被关在一个称为“地下室”的惩罚囚犯的地方，在那里经历极度的炎热，结果在2011年7月死去，终年62岁。约翰那斯·海尔被关在一个类似的牢房里将近4年，最后于2012年8月16日去世，终年68岁。三名年长的耶和华见证人，卡赫赛·梅科内、乔托莫·加布雷里西托斯以及泽哈耶·特斯法里亚姆，因被拘禁在环境恶劣的梅特尔监狱里，在获释后去世。

厄立特里亚一直无视国际人权标准。一些主要的人权机构谴责厄立特里亚侵犯基本人权，并不断敦促他们要纠正问题。

2014年，人权理事会收到厄立特里亚人权特别报告员的报告。这份报告促请该国“依国际常规”，尊重依良心拒服兵役的权利，也要“保障所有囚犯的人身安全；确保有需要者获得医药治疗”，并“依国际标准改善拘留条件”。在2015年的决议里，人权理事会要求厄立特里亚政府容许人民“出于良心拒服兵役”。

2016年，由人权理事会成立的厄立特里亚人权调查委员会指出，厄立特里亚犯下“危害人类罪”，因为该国“以宗教和族裔”为理由，迫害耶和华见证人和其他人。

2017年，非洲儿童权利与福利问题专家委员会在报告中指出，虽然厄立特里亚订立法律保护儿童的权利，“但耶和华见证人的儿童”并不能享有这些权利，而且遭受恶劣的对待。该委员会对这个问题表示关注，并建议厄立特里亚要承认和全面保障所有儿童的“思想、良心和宗教信仰自由的权利”。

2018年，非洲人权和民族权委员会建议厄立特里亚“要采取紧急措施，保障包括耶和华见证人在内的被拘禁人士的基本权利”，并要求当局调查耶和华见证人在拘留时死亡的事件。该委员会也强调厄立特里亚不应该剥夺耶和华见证人拥有“公民身份”的权利。

2019年5月，联合国人权事务委员会敦促厄立特里亚作出保证，容许人民行使宗教和信仰自由，并“释放所有因行使宗教自由而遭到逮捕或拘留的人，包括耶和华见证人”。该委员会也要求厄立特里亚要“确保在法律上承认出于良心拒服兵役，并为出于良心拒服兵役者提供民事性质的替代服务”。

在一份为期2021年5月12日的报告中，联合国特别报告员呼吁厄立特里亚政府“立即并无条件释放那些未经过审判、因信仰被监禁的人，其中也包括20名耶和华见证人”，也呼吁厄立特里亚政府不要因为耶和华见证人的信仰就剥夺他们的公民权。厄立特里亚政府该“按照非洲人权和人民权利委员会的建议，让耶和华见证人继续享有公民权，并调查在被囚期间去世的耶和华见证人的死因”。

大部分被监禁的耶和华见证人男子都被无限期的囚禁，除非濒临死亡或已死去，否则不可能离开监狱。由于该国的法律制度没有为他们提供有效的申诉途径，因此一旦入狱就等同终身监禁。

1. 2024年6月17日

   共有39位耶和华见证人被监禁。

2. 2021年2月1日

   3位耶和华见证人获释。

3. 2021年1月29日

   1位耶和华见证人获释。

4. 2020年12月4日

   28位耶和华见证人获释。

5. 2018年3月6日

   哈布特米盖尔·梅荷恩在转移到迈赛瓦监狱后去世，终年77岁。

6. 2018年1月3日

   哈布特米盖尔·特斯法马里亚姆在转移到迈赛瓦监狱后去世，终年76岁。

7. 2017年7月

   所有被囚禁在梅特尔监狱里的耶和华见证人都被转移到阿斯马拉市外的迈赛瓦监狱。

8. 2014年7月25日

   在4月14日被逮捕的人中大部分已被释放，但在4月27日被逮捕的人中有20人仍被拘禁。

9. 2014年4月27日

   有31名耶和华见证人被逮捕，当时他们正聚集在一起学习圣经。

10. 2014年4月14日

    有90多名耶和华见证人被逮捕，当时他们正举行一年一度的耶稣受难纪念聚会。

11. 2012年8月16日

    约翰那斯·海尔在环境极端恶劣的牢房中死去，终年68岁。

12. 2011年7月

    米斯金纳·盖布拉廷萨在环境极端恶劣的牢房中死去，终年62岁。

13. 2009年6月28日

    政府突击搜查一名耶和华见证人的家，逮捕所有在场参加宗教聚会的23人，当中最小的只有2岁，最年长的有80岁。

14. 2009年4月28日

    除了一个耶和华见证人，当局把其他拘留在警察局的耶和华见证人转押到梅特尔监狱。

15. 2008年7月8日

    政府开始突击搜查民宅和工作的地方，拘捕了24个耶和华见证人，他们大部分都是家庭的经济支柱。

16. 2002年5月

    政府只认可四个宗教，其余宗教团体一律被取缔。

17. 1994年10月25日

    总统下令撤销耶和华见证人的公民身份，也剥夺他们的基本公民权利。

18. 1994年9月17日

    波洛·伊亚苏、以撒·莫戈、尼格德·特克勒马里亚姆都没有经过正式起诉和审讯就被监禁。

19. 20世纪50年代

    厄立特里亚开始有耶和华见证人。