2016年12月9日，韓國國家人權委員會（下文簡稱委員會）就憲法法院正在審理的申訴案件呈交意見書，分析依良心拒服兵役的議題。委員會根據最新的人權標準，說明依良心拒服兵役是一項基本人權，是政府必須保障的權利，不應受任何限制。

委員會的報告強調，良心自由是基本人權，是拒服兵役的「正當理由」。委員會促請政府通過「能促進社會發展的替代役」來化解憲法保障的良心自由和兵役義務之間的衝突。

委員會的報告也指出，監禁因良心緣故而拒服兵役的人，是毫無意義的。委員會在報告中說：「處罰的目的是遏止人犯過、降低犯罪率。但是幾乎所有依良心拒服兵役的人不會為自己的決定感到後悔，也不會因為害怕刑罰而妥協……因此，懲處他們沒有實際的效益。」

委員會重申先前在2005年12月26日的決議，促請大韓民國引進一個替代役方案。這個方案既能顧及依良心拒服兵役者的權益，也能與現行的兵役制度並存。 a委員會基於維護人權的立場，呈交意見書給憲法法院，供法院審議時參考。

對於委員會的決定，法學教授李在承說：「如果南韓政府決定尊重依良心拒服兵役的基本人權，引進［相應的］替代役方案，我希望政府參照在國際間普遍採納的替代役安排，讓這項安排能發揮最大效用。」

耶和華見證人韓國分部發言人洪大一說：「憲法法院在2012年8月再度審查這個［依良心拒服兵役的］議題。自那時起，已有兩千多名耶和華見證人青年受監禁。我們希望憲法法院能做出一項符合國際要求的決定，表現尊重生命、促進和平的精神，讓耶和華見證人的青年能在不違反良心的情況下，為國家和社會服務，不再被監禁。」