Jehovan todistajat ovat toimineet nykyisen Israelin alueella vuodesta 1920 lähtien, ja he saavat harjoittaa uskontoaan suhteellisen vapaasti. Vuosina 1963 ja 2000 yhdistykset, joita Jehovan todistajat käyttävät toiminnassaan, saivat valtion rekisteröinnin. Valtiolta on myös pyydetty virallista uskonnollisen yhteisön asemaa vuosina 2000 ja 2014, mutta näihin hakemuksiin ei ole vielä tullut päätöstä.

Israelin lain mukaan kaikilla uskonnollisilla ryhmillä on oikeus ilmaista uskonsa julkisesti. Ääriortodoksiset juutalaiset ryhmät kuitenkin vastustavat Jehovan todistajien toimintaa, mikä on johtanut uskonnolliseen häirintään ja väkivaltaan.

Ääriortodoksiset ryhmät ovat toisinaan onnistuneet vaikuttamaan viranomaisiin niin, että todistajilta on evätty heille kuuluvia oikeuksia, esimerkiksi oikeus kokoontua. Kun paikallisviranomaiset ovat peruuttaneet todistajien tilaisuuksia, joita on ollut määrä pitää julkisissa vuokratiloissa, todistajat ovat valittaneet tuomioistuimiin. Sekä Haifan aluetuomioistuin (2007) että Israelin korkein oikeus (2015) ovat todenneet, että paikallisviranomaiset olivat syrjineet todistajia uskonnollisin perustein. Vaikka nämä tuomioistuimet puolustivatkin todistajien oikeutta kokoontua rauhassa ilman häirintää, Jehovan todistajien kokema syrjintä on edelleen jatkuva ongelma.