約瑟把馬利亞從睡夢中叫醒，告訴她一件緊急的事。原來，耶和華的天使剛剛在夢裏向約瑟顯現，對他説：「走吧，帶着小孩和他母親逃到埃及去，住在那裏，直到我給你指示，因為希律要尋找這個小孩，把他殺死。」（馬太福音2:13）

約瑟和馬利亞就連夜帶着孩子逃走了。他們走得正是時候，因為希律知道自己被占星術士愚弄了。本來希律叫占星術士要回來向他報告，但他們沒有這樣做就回家鄉去了，這使他勃然大怒。希律沒有就此罷休，還是要殺死耶穌，於是下令把伯利恆一帶兩歲以下的男孩全都殺了。這個年齡是根據占星術士告訴他的信息推算出來的。

屠殺所有男孩真是一件可怕的事！我們不知道有多少男孩被殺，但我們知道，那些失去孩子的母親痛哭哀號，應驗了先知耶利米寫下的聖經預言。（耶利米書31:15）

這時候，約瑟已經帶着家人逃到了埃及，並在那裏住了下來。後來，有一天夜裏，耶和華的天使再次在約瑟的夢中顯現，説：「走吧，帶着小孩和他母親到以色列去，因為那些想殺害這個小孩的人已經死了。」（馬太福音2:20）現在約瑟知道，他們一家人可以回家鄉去了。這應驗了聖經的另一個預言：上帝會呼召他的兒子從埃及出來。（何西阿書11:1）

看來約瑟原本想要帶一家人回到猶地亞，在伯利恆附近定居，因為他們逃到埃及之前就是住在那裏。不過，他知道希律的兒子阿基勞斯 做了猶地亞的王，而這個人十分邪惡。另外，上帝也在夢裏警告了他。於是約瑟就帶着家人一路北上，遠離耶路撒冷，到了加利利一帶的拿撒勒城。耶穌就是在這裏長大的。這應驗了另一個預言：「他要叫做拿撒勒人。」（馬太福音2:23）